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授業テーマ
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バイオインフォマティックスの基礎
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授業のねらい・到達目標
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最初に、蛋白質の立体構造について、徹底的に学習する。つづいて、基本知識・理論を学んだ後に、蛋白質の配列解析の様々な手法とホモロジーモデリングによる立体構造予測法を体得する。
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授業の方法
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最新の学問であることから適切な教科書は、なかなか見当たらない。 随時プリントなどを使用して行う。
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授業計画
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1
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ガイダンス
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2
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核酸、蛋白質、蛋白質の生合成の復習、ゲノムとポストゲノム
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3
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アミノ酸の物理化学的性質
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4
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蛋白質の二次構造、三次構造と構造の分類
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5
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蛋白質の構造と機能 具体例
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6
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分子間力
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7
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生体中の分子間力例
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8
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生物データベース
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9
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ホモロジー検索、アラインメント、アルゴリズム
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10
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二次構造予測の原理
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その他の配列解析 モチーフ・内外予測
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12
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ホモロジーモデリング法の基礎
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13
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ホモロジーモデリングの実施例：レクチンの糖認識部位
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14
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15
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その他
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参考書
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Bruce Alberts
『細胞の分子生物学』
ニュートンプレス
2005年
第5版
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成績評価の方法
及び基準
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試験(90%)
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出席状況(10%)
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オフィスアワー
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月 ２時３０分以降・火 ４時３０分以降 ８号館A210
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備考
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物理生命シミュレーションを同時に履修することが理想的である。
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