科目名  生体情報学2
          生体情報学II
  
2 単位  
 
 
3 年  
後期 
選択必修 
教員名  金子 寛生 
授業テーマ
バイオインフォマティックスの応用 
授業のねらい・到達目標
分子の運動や反応のシミュレーション技術について簡単に理解する。生体情報学Ⅰで修得した知識・方法論をもとに、蛋白質と
医薬品の分子設計の方法について詳しく学ぶ。 
授業の方法
最新の学問であることから適切な教科書は、なかなか見当たらない。随時プリントなどを使用して行う。  
事前学習・授業計画コメント
自己学習時間 プリントの復習30分 
授業計画
1
ガイダンス 
2
分子動力学計算法の基礎 
3
分子動力学計算法の生体高分子への応用 
4
構造解析 X線・NMR 
5
分子軌道法の基礎と応用 
6
蛋白質設計Ⅰ 耐熱化の戦略 
7
蛋白質設計Ⅱ 蛋白質工学 
8
蛋白質設計Ⅲ 基質特異性の変換 
9
蛋白質設計Ⅳ 反応特異性の変換 
10
触媒抗体の設計、FRETを用いた分子検出 
11
ドラッグデザインの基礎 ドッキング、構造活性相関 
12
ドラッグデザインの実例 
13
その他のバイオインフォマティックス 
14
 
15
 
その他
教科書
Bruce Alberts  『細胞の分子生物学』  ニュートンプレス  2005年  第5版
 
成績評価の方法
及び基準
試験(90%) 、 出席状況(10%)
オフィスアワー
月 2時30分以降・火 4時30分以降  8号館A210 
備考
物理生命シミュレーションについても履修していることが理想的である。