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生体情報学２
| 科目名 | 生体情報学２ | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 旧カリキュラム名 | 生体情報学II | ||||
| 教員名 | 金子 寛生 | ||||
| 単位数 | 2 | 学年 | 3 | 開講区分 | 文理学部 |
| 科目群 | 生命科学科 | ||||
| 学期 | 後期 | 履修区分 | 選択必修 | ||
| 授業テーマ | バイオインフォマティックスの応用 |
|---|---|
| 授業のねらい・到達目標 | 分子の運動や反応のシミュレーション技術について簡単に理解する。生体情報学Ⅰで修得した知識・方法論をもとに、蛋白質と 医薬品の分子設計の方法について詳しく学ぶ。 |
| 授業の方法 | 適切な教科書は、なかなか見当たらない。随時プリントなどを使用して行う。 |
| 事前学修・事後学修，授業計画コメント | 自己学習時間 プリントの復習３０分 |
| 授業計画 | |
|---|---|
| 1 | ガイダンス |
| 2 | 分子動力学計算法の基礎 |
| 3 | 分子動力学計算法の生体高分子への応用 |
| 4 | 構造解析 X線・NMR |
| 5 | 分子軌道法の基礎と応用 |
| 6 | 蛋白質設計Ⅰ 耐熱化の戦略 |
| 7 | 蛋白質設計Ⅱ 蛋白質工学 |
| 8 | 蛋白質設計Ⅲ 基質特異性の変換 |
| 9 | 蛋白質設計Ⅳ 反応特異性の変換 |
| 10 | 医学への応用 |
| 11 | ドラッグデザインの基礎 ドッキング、構造活性相関 |
| 12 | ドラッグデザインの実例 |
| 13 | 授業内容の整理 |
| 14 | 文献調査 |
| 15 | 総括 試験の解説 質疑応答 |
| その他 | |
|---|---|
| 教科書 | Bruce Alberts 『細胞の分子生物学』 ニュートンプレス 2010年 第5版 |
| 成績評価の方法及び基準 | 授業内テスト(90%)、授業参画度(10%) |
| オフィスアワー | 月 ２時３０分以降・火 ４時３０分以降 ８号館A210 |
| 備考 | 生体情報学1、特に構造生物学の知識の事前修得は必須。 物理生命シミュレーションについても履修していることが理想的である。 |