生体情報学１

授業テーマ	バイオインフォマティックスの基礎
授業のねらい・到達目標	最初に、蛋白質の立体構造について、徹底的に学習する。つづいて、基本知識・理論を学んだ後に、蛋白質の配列解析の様々な手法とホモロジーモデリングによる立体構造予測法を体得する。
授業の方法	適切な教科書は、なかなか見当たらない。　随時プリントなどを使用して行う。

授業計画
1	ガイダンス
2	核酸、蛋白質、蛋白質の生合成の復習、ゲノムとポストゲノム
3	アミノ酸の物理化学的性質
4	蛋白質の二次構造、三次構造と構造の分類
5	蛋白質の構造と機能　具体例
6	分子間力
7	生体中の分子間力例
8	生物データベース
9	ホモロジー検索、アラインメント、アルゴリズム
10	二次構造予測の原理
11	その他の配列解析　モチーフ・内外予測
12	ホモロジーモデリング法の基礎
13	授業内容の整理
14	文献調査
15	総括　試験の解説　質疑応答

その他
参考書	Bruce Alberts 『細胞の分子生物学』ニュートンプレス 2010年第5版
成績評価の方法及び基準	授業内テスト(90%)、授業参画度(10%)
オフィスアワー	月　２時３０分以降・火　４時３０分以降　　８号館A210
備考	物理生命シミュレーションを同時に履修することが理想的である。